MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	A	8	8	11	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018533	GAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
3	NC_018533	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
4	NC_018533	ACA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529934
5	NC_018533	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	403529934
6	NC_018533	CTT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529934
7	NC_018533	ATCTT	2	10	303	312	20 %	60 %	0 %	20 %	403529934
8	NC_018533	TCG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529934
9	NC_018533	GAT	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
10	NC_018533	GATT	2	8	543	550	25 %	50 %	25 %	0 %	403529934
11	NC_018533	A	6	6	573	578	100 %	0 %	0 %	0 %	403529934
12	NC_018533	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529934
13	NC_018533	GA	3	6	610	615	50 %	0 %	50 %	0 %	403529934
14	NC_018533	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
15	NC_018533	TGGC	2	8	732	739	0 %	25 %	50 %	25 %	403529934
16	NC_018533	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
17	NC_018533	CTG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529934
18	NC_018533	GAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
19	NC_018533	ATG	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
20	NC_018533	TTG	2	6	891	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529935
21	NC_018533	TGA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529935
22	NC_018533	GA	4	8	942	949	50 %	0 %	50 %	0 %	403529935
23	NC_018533	GTT	2	6	991	996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529935
24	NC_018533	GCAAAA	2	12	1008	1019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403529935
25	NC_018533	A	6	6	1016	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	403529935
26	NC_018533	A	6	6	1110	1115	100 %	0 %	0 %	0 %	403529935
27	NC_018533	GTCC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	25 %	50 %	403529935
28	NC_018533	GAAGGG	2	12	1320	1331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529935
29	NC_018533	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	403529935
30	NC_018533	T	7	7	1361	1367	0 %	100 %	0 %	0 %	403529935
31	NC_018533	TAT	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
32	NC_018533	TTA	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
33	NC_018533	TTA	2	6	1395	1400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
34	NC_018533	TGAT	2	8	1430	1437	25 %	50 %	25 %	0 %	403529935
35	NC_018533	TGT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529936
36	NC_018533	AAG	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
37	NC_018533	GAA	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
38	NC_018533	A	8	8	1614	1621	100 %	0 %	0 %	0 %	403529936
39	NC_018533	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
40	NC_018533	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529936
41	NC_018533	TGA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529936
42	NC_018533	GGT	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529936
43	NC_018533	A	7	7	1875	1881	100 %	0 %	0 %	0 %	403529936
44	NC_018533	TGCT	2	8	1900	1907	0 %	50 %	25 %	25 %	403529936
45	NC_018533	TGATT	2	10	2007	2016	20 %	60 %	20 %	0 %	403529936
46	NC_018533	TTTGT	2	10	2070	2079	0 %	80 %	20 %	0 %	403529936
47	NC_018533	A	6	6	2087	2092	100 %	0 %	0 %	0 %	403529936
48	NC_018533	ACA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
49	NC_018533	GACA	2	8	2112	2119	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
50	NC_018533	AAC	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
51	NC_018533	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	403529936
52	NC_018533	AGCA	2	8	2153	2160	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
53	NC_018533	ACGA	2	8	2268	2275	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
54	NC_018533	AGA	2	6	2283	2288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
55	NC_018533	GAA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
56	NC_018533	GCT	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529937
57	NC_018533	T	6	6	2363	2368	0 %	100 %	0 %	0 %	403529937
58	NC_018533	TGA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529937
59	NC_018533	ACAT	2	8	2453	2460	50 %	25 %	0 %	25 %	403529937
60	NC_018533	GTT	2	6	2469	2474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529937
61	NC_018533	AGA	2	6	2546	2551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529937
62	NC_018533	AAT	2	6	2552	2557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529937
63	NC_018533	AAGAAA	2	12	2572	2583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403529937
64	NC_018533	A	8	8	2615	2622	100 %	0 %	0 %	0 %	403529937
65	NC_018533	GTC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529937
66	NC_018533	A	8	8	2653	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	403529937
67	NC_018533	ATGA	2	8	2742	2749	50 %	25 %	25 %	0 %	403529937
68	NC_018533	A	9	9	2749	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	403529937
69	NC_018533	TGA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529937
70	NC_018533	A	8	8	2791	2798	100 %	0 %	0 %	0 %	403529937
71	NC_018533	CAA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529937
72	NC_018533	T	6	6	2860	2865	0 %	100 %	0 %	0 %	403529937
73	NC_018533	ATT	2	6	2908	2913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529938
74	NC_018533	ACA	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529938
75	NC_018533	GTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529938
76	NC_018533	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529938
77	NC_018533	A	6	6	3098	3103	100 %	0 %	0 %	0 %	403529938
78	NC_018533	TGA	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529938
79	NC_018533	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529938
80	NC_018533	TC	3	6	3292	3297	0 %	50 %	0 %	50 %	403529938
81	NC_018533	ATA	2	6	3326	3331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529938
82	NC_018533	TGCTT	2	10	3351	3360	0 %	60 %	20 %	20 %	403529938
83	NC_018533	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529938
84	NC_018533	CT	3	6	3473	3478	0 %	50 %	0 %	50 %	403529938
85	NC_018533	CT	3	6	3505	3510	0 %	50 %	0 %	50 %	403529938
86	NC_018533	A	6	6	3530	3535	100 %	0 %	0 %	0 %	403529938
87	NC_018533	TCA	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529938
88	NC_018533	A	7	7	3556	3562	100 %	0 %	0 %	0 %	403529938
89	NC_018533	TTC	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529938
90	NC_018533	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018533	GGGGA	2	10	3677	3686	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018533	AGG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018533	TAT	2	6	3750	3755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018533	ACTA	2	8	3786	3793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018533	A	11	11	3821	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018533	A	8	8	3874	3881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018533	ATC	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
98	NC_018533	T	7	7	3958	3964	0 %	100 %	0 %	0 %	403529939
99	NC_018533	TAC	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
100	NC_018533	TGT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
101	NC_018533	TGT	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
102	NC_018533	AGA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
103	NC_018533	TC	3	6	4233	4238	0 %	50 %	0 %	50 %	403529939
104	NC_018533	AGGA	2	8	4282	4289	50 %	0 %	50 %	0 %	403529939
105	NC_018533	GAT	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
106	NC_018533	CAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529939
107	NC_018533	ATT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
108	NC_018533	ATG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
109	NC_018533	A	6	6	4477	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	403529939
110	NC_018533	TGC	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
111	NC_018533	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
112	NC_018533	CT	3	6	4583	4588	0 %	50 %	0 %	50 %	403529939
113	NC_018533	AG	3	6	4603	4608	50 %	0 %	50 %	0 %	403529939
114	NC_018533	CAAA	2	8	4623	4630	75 %	0 %	0 %	25 %	403529939
115	NC_018533	ACG	2	6	4631	4636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
116	NC_018533	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
117	NC_018533	GCA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
118	NC_018533	AG	3	6	4906	4911	50 %	0 %	50 %	0 %	403529939
119	NC_018533	TGA	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
120	NC_018533	T	6	6	5076	5081	0 %	100 %	0 %	0 %	403529939
121	NC_018533	AAC	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529939
122	NC_018533	GCAA	2	8	5117	5124	50 %	0 %	25 %	25 %	403529939
123	NC_018533	TTG	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
124	NC_018533	GAGG	2	8	5190	5197	25 %	0 %	75 %	0 %	403529939
125	NC_018533	AGA	2	6	5276	5281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
126	NC_018533	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
127	NC_018533	TGA	2	6	5363	5368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
128	NC_018533	ATA	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529939
129	NC_018533	AC	3	6	5475	5480	50 %	0 %	0 %	50 %	403529939
130	NC_018533	A	6	6	5486	5491	100 %	0 %	0 %	0 %	403529939
131	NC_018533	TGC	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
132	NC_018533	GGA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529939
133	NC_018533	AGA	3	9	5741	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
134	NC_018533	GCTG	2	8	5759	5766	0 %	25 %	50 %	25 %	403529939
135	NC_018533	GCT	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
136	NC_018533	ATT	2	6	5925	5930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
137	NC_018533	CTT	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529939
138	NC_018533	ATT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
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423	NC_018533	TGT	2	6	18871	18876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018533	A	7	7	20442	20448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018533	GCAAA	2	10	20456	20465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
452	NC_018533	AGT	2	6	20493	20498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_018533	T	6	6	20550	20555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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